Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21972J3QN38 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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