Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
7530416G11RikJ3QJX6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms