Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vmn1r58G3X9U3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms