Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms