Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XntrpcF8VQM8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms