Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms