Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

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Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r40F6W043 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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