Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms