Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms