Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930451I11RikE9Q9R3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930451I11RikE9Q9R3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms