Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms