Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms