Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms