Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm3298E9PW80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm3298E9PW80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3298E9PW80 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms