Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nkx6-2D3Z4R4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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