Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc8D3YZV8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc8D3YZV8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms