Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol6B7ZC55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms