Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf518bB2RRE4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms