Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brpf3B2KF05 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms