Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprsB0V2N1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprsB0V2N1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms