Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms