Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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