Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms