Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms