Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms