Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ism1A2ATD1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ism1A2ATD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms