Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r2A2AMT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms