Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms