Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms