Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms