Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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