Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms