Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms