Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms