Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAMA3Q16787 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms