Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NTRK2Q16620 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms