Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms