Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms