Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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