Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms