Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms