Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms