Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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