Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms