Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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