Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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