Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms