Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngr4Q9Z1L2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms