Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Padi1Q9Z185 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Padi1Q9Z185 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.5 ms