Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp2Q9Z0Z3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms